Las características del contrato, en cuanto a titulación requerida, salario, y duración dependerán del perfil de los candidatos potenciales y se realizará de acuerdo con los procedimientos de contratación temporal del CSIC.

Los interesados deben ponerse en contacto con Ramón González mediante e-mail (ramon.gonzalez@csic.es) o teléfono (941299684) antes del 24 de febrero de 2012.

Descripción:
El trabajo está integrado dentro de un proyecto de estudio genómico de la esquizofrenia y consiste en el almacenamiento, procesamiento y análisis de datos producidos por sistemas de secuenciación de RNA/DNA de nueva generación (Illumina). Se analizará el transcriptoma, la expresión diferencial entre grupos de individuos, la caracterización de variantes y su asociación estadística con diversos fenotipos.

Requisitos:

Título de Licenciado en Informática o titulación similar.
Capacidad para la programación y manejo y análisis de datos de NGS (“Next Generation Sequencing”)
Se valorará la experiencia en bioinformática, el conocimiento de la estructura del genoma, la motivación y la capacidad de comunicación.

Sueldo y condiciones:
Salario 35.314 € brutos anuales. La plaza está dotada para 15 meses.

Los solicitantes enviarán el Currículo Vitae con descripción de la experiencia profesional y datos de contacto (teléfono y correo electrónico incluidos) del solicitante y  de dos personas para dar referencias a:

Dr. Jesús Sainz, Científico Titular (CSIC)
Facultad de Medicina
Ave. Cardenal Herrera Oria s/n
39011 Santander, Spain

Correo electrónico: sainzjv@unican.es
Teléfono: +34-942-201577

1)  The application of ontologies to the automation of biological  analyses, primarily through the automated discovery of, and correct  assembly of, Web Services into analytical workflows.

2)  Overcoming “the well-known knowledge acquisition bottleneck” through  attempts to construct ontologies using crowd-sourcing and data-driven  approaches

3)  Exploring the relationship between ontologies and hypotheses, with  respect to both automated in silico hypothesis evaluation and comparison,  and the formalization of scientific discourse using OWL.

Madrid is home to a thriving informatics research community!  The  laboratory will be based in the newly constructed Center for Plant  Biotechnology, directly adjacent to the Supercomputing and Visualization Center of Madrid, providing excellent opportunities for collaboration with the HPC groups at that Center, as well as with the well-established
Ontology Engineering Group in the Faculty of Informatics, UPM, and with bioinformatics researchers at Madrid’s National Institute for  Bioinformatics (INB).

…and just imagine… doing linked-data and semantic web research without privacy constraints! 

Please send questions, CVs, and expressions of interest to this email: markw@illuminae.com

Cancer_modeling_Alacris_Berlin_ALA_CANMod_032012.pdf

Next_Generation_Sequencing_Bioinformatician_ALA_PIPSeq_032012_Berlin.pdf

Formación: Licenciado en Biología.

Experiencia: Experiencia mínima demostrable de  2 años en análisis bioinformático.Experiencia en análisis NGS y análisis de datos de microarrays.

Deseable:
Conocimiento Inglés : Hablado y escrito
Disponibilidad para viajar a nivel nacional
Conocimientos de Bioconductor.

Interesados mandar CV a:   info@bioarray.es

Bioinformatics Open Days event will occur in the 1st and 2nd of March of 2012 at the University of Minho in Braga. It will be a great opportunity to bring together a community interested in the field of Bioinformatics.

During these days, several activities will bring the major Bioinformatics subjects to discussion. Among them you will find posters and oral presentations from invited speakers and an open forum with representatives from Bioinformatics Industry working in Europe.

Bioinformatics Open Days will be a privileged event where you can get new insights on Bioinformatics and find the latest advancements in the Academic research and Industry.

We gladly accept posters submissions regarding any topic related to Bioinformatics and hope to meet you in Bioinformatics Open Days!

The EU-Codefest will take place on 19 and 20 July 2012, in Lodi, Italy, near the Bergamo and Milano airports (Bergamo is a hub for Ryanair).

The EU-Codefest is modeled on the successful biohackathons in Japan, though we would like it more free-flowing. There will be few invited speakers, and instead attendees will have a chance to give micro-presentations on their ongoing open source projects. In short, the focus of the EU-Codefest will be on coding, open source projects, and general fun. We also hope to show BOSC talks on video.

The weekend of 21 and 22 July we can continue (unofficially) to have a good time, and will try to organise some outings.

Please mail * eucodefest2012@gmail.com * if you are interested in attending. We need to get a feel for the number of people coming. But, hey, even if it is just us we will be perfectly happy hacking away :)

Organising committee: Francesco Strozzi, Raoul Bonnal and Pjotr Prins

In silico Systems Biology, 23 – 27 April 2012

Conference website: www.wellcome.ac.uk/advancedcourses

Deadline for applications: 3 February 2012

The course is aimed at advanced PhD students, post-doctoral and more senior researchers who are using or planning to use systems-based approaches to understanding biomedical problems.

Topics:
- Overview of the field of Systems Biology: past, present and future
- Network Analysis
- Qualitative Modelling: modelling and simulation of interesting networks and pathways, as well as analysis of dynamical systems
- Quantitative Modelling, in particular discrete modelling and stochastic simulations
- Network and Pathway Enrichment
- Importance of semantics in systems biology: how to annotate models, and how to use those annotations to understand, merge and reason on models
- Programmatic approaches (e.g. libSBML)

We look forward to welcoming you to Cambridge, UK.

Nicolas Le Novere, European Bioinformatics Institute, UK
Julio Saez-Rodriguez, European Bioinformatics Institute, UK
Vicky Schneider, European Bioinformatics Institute, UK

If you have any questions, please do not hesitate to contact advancedcourses@hinxton.wellcome.ac.uk.

EMBL-EBI European Bioinformatics Institute
Please subscribe at www.embl.org/events/newsletter for our newsletter.

If you do not wish to receive any further information about events taking place at EMBL, please reply with “unsubscribe” in the subject.

Centro:
Grupo de Ingeniería de Bioprocesos, IIM-CSIC, Vigo
Ver  http://www.iim.csic.es/~gingproc/

Requisitos:
Candidatos/as (nacionalidad española o de la UE) que reúnan alguna de las siguientes características:
- Licenciados/as en Matemáticas, Físicas o Químicas (especialidades de Industrial o Química-Física)
- Ingenieros/as Químicos, Informáticos o Industriales
- Ingenieros/as o licenciados/as de otras titulaciones con
experiencia demostrable en simulación y optimización numéricas

Se valorará especialmente:
- Buen expediente académico
- Muy buen nivel de inglés
- Experiencia en lenguajes de programación (ej.Matlab, C, Java, Fortran) y métodos numéricos (simulación, optimización)

Los/as seleccionados/as se incorporarán al Grupo de Ingeniería de Bio-Procesos del IIM-CSIC en Vigo.
Web: http://www.iim.csic.es/~gingproc/

IMPORTANTE:
Los interesados/as deben de contactar urgentemente por e-mail con <gingproc@iim.csic.es> , adjuntando:
(1) su curriculum y (2) expediente académico (como documentos PDF).

La selección de candidatos se realizará de acuerdo con los criterios especificados en la convocatoria.

Más información en el mismo email, <gingproc@iim.csic.es>  .

Condiciones del programa FPI 2012:
http://alturl.com/wj569